Mini Ninjas je akční pohádková adventura, která zabaví jak děti, tak dospělé. Stanete se Hirem, nejmenším hrdinou na světě, a vydáte se na vzrušující výpravu, jejíž cílem je obnovení harmonie ve světě, který stojí na pokraji chaosu. Hiro bude mít na pomoc dalších 5 společníků, které na své cestě postupně zachrání.

Po 7 hodinovém příběhu rozděleném do 22 kapitol se utkáte se samotným nepřátelským samurajem, který chce ovládnout svět.